I Estland har Jevgeni kritiserats för att han inte tillräckligt tydligt fördömt Rysslands anfall mot Ukraina. I oktober gav Estlands justitieministerium rakt besked: om inte Jevgeni tar avstånd från Kirill och fördömer Rysslands anfall mot Ukraina förnyas inte hans uppehållstillstånd. Den 12 oktober meddelade Jevgeni att han inte håller med Kirill om att de ryska soldater som stupar i kriget får syndernas förlåtelse, och han godkänner inte heller krigspropaganda i sin egen kyrka.
– Många i Estland misstänker att Jevgenis uttalanden inte är ärliga. Man har till och med talat om att lägga ner den ortodoxa kyrka som lyder under Moskvapatriarkatet, säger Mikko Ketola, docent i kyrkohistoria, till tidningen Kotimaa.
